W dniu 22 grudnia 2011 r. zatwierdzona została znowelizowana wersja Zasad dokonywania wyboru projektów w ramach Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki. Obowiązywać będą one dla konkursów ogłaszanych oraz dla wniosków o dofinansowanie projektów systemowych składanych od dnia 1 stycznia 2012 roku. Dokument udostępniony został na stronie internetowej www.efs.gov.pl oraz w Bazie Wiedzy Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki.

Do najważniejszych zmian wprowadzonych w dokumencie należy: składanie wniosków o dofinansowanie wyłącznie drogą elektroniczną, a także wprowadzanie do Planów działania  (począwszy od Planów działania na 2013 rok i lata następne) obowiązku przedstawiania przez Instytucję Pośredniczącą informacji, co do planowanych do osiągnięcia rezultatów (wskaźników monitorowania) poszczególnych konkursów. Wymagane będzie również doprecyzowanie zapisów dotyczących możliwości dokonywania oceny projektów systemowych przez ekspertów, celem usprawnienia procesu ich oceny merytorycznej. Zgodnie z postulatami beneficjentów wprowadzony zostanie zapis dotyczący obowiązku powołania w ramach projektów systemowych Grupy Sterującej, w skład której wchodzą projektodawca, partnerzy projektu (o ile projekt przewidziany jest do realizacji w partnerstwie) , przedstawiciel/e instytucji będącej stroną umowy o dofinansowanie (IP lub IP2) oraz przedstawiciele środowisk reprezentujących grupy docelowe, do których kierowane będzie wsparcie w ramach projektu jeśli będzie to zasadne. Wprowadzenie zapisów, w których do dofinansowania wybrany zostanie tylko jeden projekt, a także rozszerzenie kompetencji przewodniczącego Komisji Oceny Projektów, dzięki czemu w razie wadliwie lub niepełnie dokonanej oceny, przewodniczący KOP może podjąć decyzję o skierowaniu wniosku do negocjacji w kwestionowanym zakresie. Wprowadzenie zapisu, że przy opracowywaniu listy dokumentów wymaganych przed podpisaniem umowy o dofinansowanie w dokumentacji konkursowej IOK powinna w miarę możliwości uwzględnić ustawę z dnia 25 marca 2011r. o ograniczaniu barier administracyjnych dla obywateli i przedsiębiorców (Dz. U. Nr 106,poz.622,z późn. zm.) wprowadzającą w wielu przypadkach prawo składania oświadczeń w miejsce obowiązku przedstawienia zaświadczeń.

W zakresie dotyczącym procedury odwoławczej: uspójnienie podrozdziału z wydanym przez IZ PO KL komunikatem dotyczącym niedopuszczalności wniesienia skargi do WSA w sytuacji pozostawienia środka odwoławczego bez rozpatrzenia, doprecyzowanie dotyczące sposobu przeprowadzania ponownej oceny w wyniku uwzględnienia środka odwoławczego, sposobu doręczeń pism dotyczących procedury odwoławczej oraz sposobu sporządzania odpowiedzi na środki odwoławcze.

Zmieniony został również wzór Karty oceny merytorycznej wynikającej z przyjęcia przez Komitet Monitorujący PO KL zmian w ogólnych kryteriach wyboru projektu.