Procedura oceny wniosków składanych do LGD powinna zapewniać jasny podział zadań i zakres odpowiedzialności poszczególnych organów LGD w procesie oceny. Przykładowo, beneficjenci składający wniosek o przyznanie pomocy na operacje w ramach działania „Wdrażanie LSR”, mogą przy jego przygotowywaniu korzystać z pomocy pracownika biura LGD. Natomiast ocena i wybór danego wniosku beneficjenta powinien należeć do organu decyzyjnego LGD.
Należy pamiętać o tym, że żaden z członków organu decyzyjnego nie może być zatrudniony w biurze LGD oraz należy określić procedurę wyłączenia członka organu decyzyjnego od udziału w dokonywaniu wyboru operacji w razie zaistnienia okoliczności, które mogą wywołać wątpliwości co do jego bezstronności, w szczególności w przypadku ubiegania się przez członka organu decyzyjnego o wybór jego operacji w ramach działania „Wdrażanie LSR”.
Wyboru operacji dokonuje się na podstawie kryteriów zgodności operacji z LSR oraz kryteriów wyboru operacji. Jednakże pracownicy biura LGD doradzając beneficjentowi w zakresie przygotowywania wniosków o przyznanie pomocy mogą zalecić dokonanie poprawek, jeśli okazałoby się, że wniosek jest np. niekompletny lub błędnie wypełniony.
Natomiast czynności związane z weryfikowaniem wniosku pod kątem zgodności z PROW, wezwania do ewentualnych uzupełnień i podpisywanie umów przyznania pomocy jest zadaniem podmiotu wdrażającego tj. w przypadku operacji z zakresu działania „Odnowa i rozwój wsi” oraz małych projektów – samorząd województwa, a w przypadku operacji z zakresu działania ‘Różnicowanie działalności w kierunku nierolniczej” oraz „Tworzenie i rozwój mikroprzedsiębiorstw” - ARiMR.