Zgodnie z przepisami zawartymi w § 4 ust. 2 koszty uznaje się za koszty kwalifikowalne, jeżeli zostały poniesione po dniu złożenia wniosku o przyznanie pomocy, a w przypadku kosztów stanowiących koszty ogólne, niewcześniej niż od dnia 1 stycznia 2007 r. Jednocześnie w przypadku operacji, dla których wymagane jest stosowanie Prawa Zamówień Publicznych: dostawy, roboty budowlane i usługi, związane z realizacją operacji, zostały nabyte w trybie przepisów o zamówieniach publicznych, a postępowanie o udzielenie zamówienia publicznego zostało wszczęte po dniu złożenia wniosku o przyznanie pomocy. Dlatego też, rozpoczęcie operacji to poniesienie kosztów kwalifikowanych związanych z jej realizacją.